Ylijääneet tortillat kannattaa pakastaa. Jokaisen tortillalevyn väliin laitetaan leivinpaperi ja tortillat pakastetaan sen jälkeen pakastepussissa. Näin tortillat säilyvät pitkään, vaikka pakkaus olisi avattu ja pakkasesta niitä voi sulattaa vaikka yksi kerrallaan.